Обучение в аспирантуре и докторантуре ведется по следующим научным специальностям: 

• 05.13.01 - Системный анализ, управление и обработка информации;
• 05.13.06 - Автоматизация и управление технологическими процессами и производствами;
• 05.13.10 - Управление в социальных и экономических системах;
• 05.13.11 - Математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей;
• 05.13.18 - Математическое моделирование, численные методы, комплексы программ;
• 05.13.19 - Методы и системы защиты информации, информационная безопасность.